מרדכי דיסקין נולד בשנת 1839 בעיר גרודנה שברוסיה הלבנה, לאביו יצחק, גנן ומוכר ירקות. בגיל צעיר למד בחדרים ובישיבות, אך בשל צורכי הפרנסה, החל מגיל בר מצווה סייע לאביו בעבודות הגינה, תוך שהוא מקפיד להקדיש זמן ללימוד תורה.
בגיל 17 נשא לאישה את דינה, בת ר' בנימין מאיר הכהן. בני הזוג עסקו יחד בגידול ירקות – הוא בגינה, והיא במכירת התוצרת בעיר. למרות העבודה הקשה, שמר דיסקין על אורח חיים תורני ושקד על לימוד התורה בשעות הפנאי.
בשנת 1882, כששמע שיהודים החלו לעבד את אדמת ארץ ישראל, עלה עם משפחתו ורכש נחלה בפתח תקווה. המושבה הייתה אז נטושה בשל קדחת קשה, והשנה גם חפפה לשנת שמיטה, כך שלא ניתן היה לעבוד את האדמה. למרות התנאים הקשים והבדידות, החל דיסקין בעיבוד אדמתו, תוך התמודדות עם מחסור במים, מחלות, ומתקפות שוד של שכניהם הערבים.
אחד מגידוליו הבולטים היו המלפפונים, שזכו לביקוש ואף ניסיונות גניבה. באחד המקרים נורה ונפצע על ידי גנב, אך העדיף לטפל בפצוע ולא לוותר על הצדק – עמד על הגשת תלונה מלאה למשטרה כדי להבהיר שאין להפקיר דם יהודי.
לצד עבודתו החקלאית, הקדיש מרדכי דיסקין זמן ללימוד תורה בציבור, והרבה למסור שיעורים בבית הכנסת. כאשר נזקק לפרנסה נוספת, הפך לעגלון ועסק בהובלת נוסעים וסחורות בין פתח תקווה, יפו ולוד – מקצוע שנחשב בזוי בעיני הסובבים, אך דיסקין ראה בכך עבודה כשרה, כדוגמת חכמי התלמוד.
בשל לחצי בני משפחתו ורעייתו, עזב את מלאכת העגלונות ופתח חנות בפתח תקווה. גם אז המשיך בלימוד תורה, בפעילות ציבורית, ובמעשי חסד – ביניהם הקצאת ביתו לאירוח חולים שהגיעו ליפו מהמושבות.
במהלך השנים פנה לקרנות חוץ-ארץ בבקשה למימון השקיה או סיוע כלכלי, אך סורב. כמו כן, סירב לקבל מימון מותנה בחילול מצוות השמיטה, מתוך נאמנות לעקרונותיו הדתיים. בשנת 1913 פרסם את ספרו "יישוב הארץ", העוסק בנטיעת עצים ואתרוגים בארץ ישראל, ובהמשך הוציא גם חוברת זיכרונות בשם "מאמר מרדכי".
מרדכי דיסקין נפטר בפתח תקווה בכ"ז באב תרע"ד (1914), ורעייתו דינה נפטרה בתרפ"ג (1923).
על מצבתו נכתב:
לזכר עולם יהיה צדיק פנ' פנ' עסקן צבורי ומרביץ תורה ברבים ואחד מהחלוצים הראשונים אשר רבות פעל לטובת הישוב בכלל ובפרט להמושבה פ"ת במשך ל"ג שנה מאז באו מחו"ל וביהוה עמל הרבה לבנות וליסד הת"ת וביהכ"נ הגדלה דפה ה"ה הרב הישיש המפורסם הנכבד הירא אלהים מרדכי ב"ר יצחק דיסקין ז"ל בעה"מ ספרי "דברי מרדכי" ו"ישוב א"י", נפטר בש"ט ביום כ"ז מנ"א תרע"ד תנצב"ה
צאצאים:
- בנימין [1863 – 1945] נולד בגרודנה, נפטר בתל אביב. קברו בבית העלמין סגולה בפתח תקוה
- חנה פרל – נישאה לאריה ליב, בנו של ר' יואל משה סלומון.
